Guías de la historia
La historia de PBO recorre cuatro regiones, una detrás de otra. Cada guía sigue las misiones de la Historia principal de esa región en el Rastreador de misiones, con todos los Líderes de Gimnasio, el rival y el equipo villano, las MO y los puzles de los Gimnasios. Contienen spoilers.
Las cuatro regiones en orden
Sección titulada «Las cuatro regiones en orden»| Orden | Región | Dónde empieza | Puedes ir |
|---|---|---|---|
| 1 | Sinnoh | Twinleaf Town | Desde el principio |
| 2 | Jvaloh, la región propia de PBO | Route 219, al sur de Sandgem Town | Después de la historia de Sinnoh, cuando  Buck, en Stark Mountain, recupera la Piedra Magma |
| 3 | Hoenn | Littleroot Town, en barco desde Snowpoint City | Cuando termina la historia de Jvaloh, en la Dragon Tower |
| 4 | Kanto | Pallet Town, en barco desde Lilycove City | Cuando te conviertes en Campeón de Hoenn y terminas las misiones de Cielos más allá de Hoenn |
Viajar entre regiones
Sección titulada «Viajar entre regiones»Cuando una región ya está abierta, puedes ir y volver sin repetir el viaje. Los teletransportadores de cada región solo cubren esa región, pero hay tres lugares con un 
teletransportador que da servicio a todas las regiones: Spring Valley (Sinnoh), el Crew Wars Lobby y la Champion’s Hall Tournament Room.
| Dónde estás | Cómo llegar a un teletransportador entre regiones |
|---|---|
| Sinnoh | Cualquier teletransportador va a Spring Valley. El de Hearthome City también va al Crew Wars Lobby cuando tienes 3 medallas de Sinnoh. |
| Hoenn o Kanto | Todos los teletransportadores incluyen Spring Valley y el Crew Wars Lobby. |
| Jvaloh | Los teletransportadores de Jvaloh no salen de Jvaloh. Cuando tienes una medalla de Jvaloh, el  Tournament Assistant de cualquier Centro Pokémon de Jvaloh te envía gratis a la Champion’s Hall Tournament Room. Antes de eso, vuelve por donde viniste: desde New Dawn Town, regresa surfeando por la Route 219 hasta Sandgem Town. |
En un teletransportador entre regiones, una ciudad de otra región aparece en la lista cuando tienes las medallas que esa ciudad pide en su propia región. Necesitas al menos 1 medalla en Jvaloh, Hoenn o Kanto para que aparezca cualquier ciudad de esa región.
Los barcos también siguen funcionando:
- Hoenn:
Sailor Bucky, en el muelle de Snowpoint City, navega hasta Crosswave Isle, donde el camión de 
Driver Rusty te lleva hasta Littleroot Town. Driver Rusty, en Littleroot, te lleva de vuelta a Crosswave Isle, y Bucky te devuelve en barco a Snowpoint. - Kanto: Sailor Marcus, en el puerto de Lilycove City, navega hasta Pallet Town, y desde Pallet Town te trae de vuelta.
Tu antiguo equipo en una región nueva
Sección titulada «Tu antiguo equipo en una región nueva»Los Pokémon que capturaste en una región anterior no conservan toda su fuerza en una nueva hasta que derrotas al Alto Mando de esa región:
| En | Los Pokémon de regiones anteriores combaten a |
|---|---|
| Jvaloh y Hoenn | Como máximo nivel 5, más 5 por cada medalla que tengas de la región en la que estás (consulta niveles máximos según tus medallas) |
| Kanto | Nivel 1 |
Los Pokémon capturados en la región en la que estás jugando nunca se ven limitados, así que captura un equipo nuevo sobre la marcha. Los Pokémon de una región posterior tampoco se ven limitados cuando vuelves a una anterior.