Hoenn es la región con más contenido secundario de PBO, y la mayor parte se abre cuando te conviertes en Campeón de Hoenn: varias misiones de Megapiedras, los Regis, el dúo Eón y combates semanales contra Campeones. Las guías de abajo dan las soluciones completas, así que contienen spoilers.
Sage Eron y los Regis
Explora tres cavernas para 
Sage Eron, resuelve un acertijo y después combate cada día contra los Regis.
Necesitas: ser Campeón de Hoenn y un trío capturado por ti (cambia cada 4 meses)
Recompensa: combates diarios contra 
Regirock, 
Regice y 
Registeel, y núcleos Regi para fabricar
El dúo Eón
Libera a 
Latios y 
Latias de 
Archie y del Equipo Aqua en el Secret Islet.
Necesitas: ser Campeón de Hoenn y 500 Pokémon capturados
Recompensa: 
Flauta Eón y Latios o Latias itinerante
Blazikenita, Sceptilita y Swampertita
Calma a tres iniciales megaevolucionados para 
May, 
Professor Cozmo y 
Wally con objetos hechos a partir de iniciales del Safari.
Necesitas: ser Campeón de Hoenn y 10 iniciales del Safari con IV altos de cada uno
Recompensa: los Campeones May, Cozmo y Wally; 
Blazikenita, 
Sceptilita y 
Swampertita
Metagrossita
Reconstruye la piedra hecha añicos de 
Steven a partir de tres fragmentos.
Necesitas: ser Campeón de Hoenn, la línea evolutiva de 
Beldum capturada por ti, Buceo, nivel de pesca 20 y un Metagross de nivel 100
Recompensa: 
Metagrossita
Aerodactylita
Reúne cinco fragmentos de 
Aerodactyl para 
Ruin Maniac Dusty.
Necesitas: un Aerodactyl capturado por ti, un Swellow de nivel 100 capturado por ti, un Lileep o un Anorith capturado por ti, nivel de minería 40 y el Campeón Cozmo (de la misión de la Sceptilita)
Recompensa: 
Aerodactylita
Salamencita
Sigue a 
Drake por tres regiones y véncelo tres veces.
Necesitas: ser Campeón de Hoenn y un 
Kingdra, un 
Altaria y un 
Salamence capturados por ti
Recompensa: 
Salamencita
Maxie y la Cameruptita
Maxie es un Campeón semanal en la Cave of Origin.
Necesitas: ser Campeón de Hoenn y 10 legendarios capturados
Recompensa: posibilidad de conseguir 
Cameruptita
Llamas Etéreas y Sableynita
Reúne 100 llamas escondidas en tres regiones.
Necesitas: 7 medallas de Sinnoh para empezar; los mapas de las llamas también necesitan los niveles de minería 60 y 80, 400 Pokémon capturados, ser Campeón de Sinnoh y boletos Safari
Recompensa: 
Sableynita
Officer Jenny y el Frasco Castigo
Encuentra la llave de la prisión de 
Jenny en la Shoal Cave y desenmascara a una impostora.
Necesitas: 400 Pokémon capturados, 50 de Limo Púrpura y un 
Arcanine
Recompensa: 
Frasco Castigo y la Campeona Jenny
El Baxcalibur desaparecido
Persigue a un 
Baxcalibur fugado por tres escondites.
Necesitas: 7 medallas y 300 Pokémon capturados
Recompensa: acceso a 
Frigibax salvajes
Encontrar a King Bisharp
Enséñale a 
Blaze's Aide un 
Bisharp de nivel 100 y después derrota a King Bisharp en su guarida oculta de Mt. Pyre.
Necesitas: un Bisharp de nivel 100 capturado por ti y 8 medallas de Hoenn
Recompensa: 
Cresta Líder, que hace evolucionar a Bisharp en 
Kingambit
Los encargos del alcalde de Pacifidlog
Encuentra a la tripulación perdida, la carga y el cuaderno en los Abandoned Ships hundidos para el alcalde de Pacifidlog Town.
Necesitas: 8 medallas de Hoenn y Buceo
Recompensa: 12,500 F en total, 
Piedra Agua, 
Pedazo Estrella y 
Fragmento Cometa; abre los Abandoned Ships
Las Brujas de Mt. Pyre
Vence a diez entrenadoras de niveles 80–100.
Reinicio: semanal (lunes)
Recompensa: 5,000 F y un objeto de 
Hex Maniac Katrina Crane
La Seashore House
Vence a cinco entrenadores en la Route 109.
Reinicio: diario
Recompensa: 4,000 F y un objeto de 
Owner Mike
La Guardería de Hoenn
Enséñale cada día a 
Breeder Tia un Pokémon de Hoenn nuevo que hayas capturado tú.
Reinicio: diario
Recompensa: 
Ficha de Guarderíax15–45 por Pokémon
Todas en una sola página: Misiones pequeñas de Hoenn. Todas las Poké Balls con objeto de la región están en Objetos en el suelo de Hoenn.
| Misión | Empieza en | Recompensa |
|---|---|---|
| Peticiones para enseñar Pokémon | Oldale, Petalburg, Rustboro | Dinero y objetos |
| La familia Winstrate | Route 111 | Dinero cada día |
| La entrega de Buceo Balls | Verdanturf Town |  Buceo Ballx5 |
| La muñeca de Xueying | Verdanturf Town |  Armadura Auspiciosa o  Armadura Siniestra |
| El capataz de minería | Lavaridge Town | Kit Génesis del Minero |
| La Shoal Cave y la Campana Concha | Route 125 |  Campana Concha |
| El esnórquel perdido de Finn | Treasure Hunter House, Route 124 | La tienda de Perlas Abisales de Finn |
¿Buscas la historia principal? Consulta la guía de la historia de Hoenn. Para ver todos los combates contra Campeones, consulta Gimnasios, Alto Mando y Campeones.
